Если в ООО единственный учредитель, кого ставить в ликвидационную комиссию?

Согласно части 3 статьи 62 ГК РФ, участники юридического лица назначают ликвидационную комиссию (ликвидатора). То есть это необязательно должна быть комиссия, может быть и один человек — ликвидатор. В вашем случае им может быть назначен единственный участник.